常见的原因有多种，单一因素或多种因素都可诱发复发情况。天气变化会诱发胃肠蠕动障碍，首次补食时胃肠会承受不了，从而出现消化功能异常，诱发肠套叠。近期的腹泻可能诱发肠套叠，病毒等，易引起肠蠕动异常的肠套叠等。儿童肠功能障碍是最常见的，也是病发率最高的。